Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms