Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD53Q8N9V6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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