Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP13Q86W25 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP13Q86W25 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms