Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms