Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RTL6Q6ICC9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL6Q6ICC9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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