Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRAMD4Q6IC98 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms