Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms