Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms