Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms