Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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