Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK4Q16099 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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