Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms