Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms