Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRADDQ15628 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRADDQ15628 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRADDQ15628 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRADDQ15628 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRADDQ15628 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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