Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNIP1Q15025 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms