Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GAPVD1Q14C86 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAPVD1Q14C86 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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