Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHPRHQ149N8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms