Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCARF1Q14162 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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