Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPM6BQ13491 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms