Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SP140Q13342 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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