Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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