Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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STRN3Q13033 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRN3Q13033 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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