Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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