Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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