Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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