Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms