Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms