Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLOD1Q02809 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms