Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms