Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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