Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN17P56750 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN17P56750 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN17P56750 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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