Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCR4P51679 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCR4P51679 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCR4P51679 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms