Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFBP49765 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFBP49765 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms