Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPFP49454 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPFP49454 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPFP49454 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPFP49454 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPFP49454 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPFP49454 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms