Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A3P48751 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms