Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCLMP48507 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms