Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms