Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA4P43681 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms