Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD6P30203 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD6P30203 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD6P30203 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms