Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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