Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRDP23468 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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