Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDSP20132 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDSP20132 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDSP20132 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDSP20132 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms