Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DESP17661 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DESP17661 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms