Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME1P15531 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME1P15531 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME1P15531 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME1P15531 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms