Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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