Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RARBP10826 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RARBP10826 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RARBP10826 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RARBP10826 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARBP10826 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms