Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM10L1P0DMW3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms