Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB1P08034 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms