Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms