Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEPDC5O75140 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms